儿童剧《飞越母亲河》讲述的是一个关于梦想的童话故事。在黄河源头生活着一只名叫吉祥的黑颈鹤，刚一出生就失去了双亲，翅膀也受了重伤的它，在藏族男孩扎西照顾下长大了。春天，众鸟回归，一起谈论飞行，吉祥这才知道了什么是真正的飞行，并在心底产生了飞越黄河，去看大海的梦想!善良的斑头雁大婶对吉祥的命运深为同情，它不仅主动教吉祥学飞，还陪它踏上了寻梦之旅。

途中，吉祥在一次次的磨砺中快速成长，变得更加勇敢坚强!暴风雨的考验曾让吉祥一度想要放弃，但在东乡族女孩法图麦的激励下，他重又燃起了勇气!在遭到了野兽袭击时，斑头雁大婶始终像母亲一样保护吉祥，而吉祥也勇敢地冲上前帮助斑头雁逃出魔掌。斑头雁大婶的翅膀断了，又是吉祥及时找来了汉族孩子杜小飞兄妹，将他们救回了野生动物保护站。

在人类的精心救治下，斑头雁终于痊愈。吉祥在斑头雁的陪伴下终于来到黄河入海口，他们不仅看到了黄蓝交汇的壮丽景象，也最终完成了吉祥飞越母亲河的梦想......!